Климотолог
Научные интересы А. В. Пенюгалова касались, прежде всего, гидрологии, климатологии и микроклиматологии Крыма. Работая в комиссии по изучению производительных сил Крыма, он подготовил главную свою монографию “Климат Крыма. Опыт климатического районирования”, изданную Крымским государственным издательством в 1930 году и представляющую собой расширенный доклад, составленный к Съезду производительных сил Крыма.